众将纷纷点头赞同。
杜正信起身道：“大将军，既然我军现已是独立之师，不尊他令。我认为可将军队规制做一下调整。以大将军为统帅，各个部营有条理的划分，明确职能，便利于统一调度，这才是一支纪律严明、部署有致的军队，也便是一支能够成就大业的军队！”
薛常亮道：“好，此提议尚好，是应该重新规整一下了。”
众将纷纷附议。
薛常亮与众将商议了多日，便集合所有兵马，薛常亮自拟大将军令，军队建制如下：
军队以大明为旗幡号，所统七万五千兵马，分为四师二十四营。
薛常亮为全军统帅，号大明平北忠义军复国大将军。
北军涧龙师，张良为帅，号大明平北忠义军骁勇将军，领七营八十四帐共两万三千人。
南军伏牛师，王志为帅，号大明平北忠义军忠勇将军，领六营五十四帐共一万八千人。
西军啸虎师，祁康为帅，号大明平北忠义军智勇将军，领七营七十八帐共两万一千人。
东军烈马师，杜正信为帅，号大明平北忠义军义勇将军，领四营二十六帐共一万人。
其余人员分属后勤粮草等部，魏孝先为主事，王志兼为督办，以示此项乃重中之重。
各营帐也将人员分派妥当，其中阮明和及鲁连芳各管西军一营，从祁康调派；郭子商与仇禄各管东军一营，从杜正信调派；皇甫三兄弟各管北军一营，从张良调派；付谦管南军一营，从王志调派。
其余各营帐也各得归属，就连吕文长也有派遣，薛常亮令其统辖一帐约百余青年军，分属王志的南军，其意当然是想磨练他一番。
待调派军令下达后，薛常亮将人马分置莫干山四个方位驻兵，且中间相隔不远，互通联系，薛常亮坐镇中央，以便调派，如此，大军在莫干山驻扎了下来。其间不乏南逃的明国遗民或立志报国之人听闻薛家军名号前来投奔从军，薛常亮亦是将他们规整至各营帐，一时间，习武操练、骑马涉猎，便也消停了半个多月，军队也由此发展为近九万人。
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