除了荷兰人的海军有少部分军队逃脱之外，其陆军的命运则要悲惨的多，一共两千两百一十七人的军队，其中战死五百一十七人，被俘一千六百六十八人，三十二人失踪，这些人估计还在城中。应该是躲在了民居里面了，等到之后中华军的清剿行动展开就能够将他们解决掉。
这些被俘的士兵中间有很多人都受伤了。其中大部分都是被炮弹炸伤的，人数多达四百多人，伤员之中有很多是重伤员，中华军这一次出兵虽然物资携带了很多，但是医药的携带数量却不多，这主要是军中比较缺乏大夫，而宝贵的药材王佐才显然是不想浪费在这些重伤员的身上了，就算是要救，那也是先救中华军自己的伤员再说。
对于这样的安排荷兰人虽然抗议，但是中华军士兵们根本就不会去理会他们的感受，直接将轻重伤员一区分然后将所有的重伤员全部抬出去“解决”掉了，这对于他们来说未尝不是一种解脱，在巴达维亚的这种酷热的天气里面，这种开放性的伤口是极容易感染化脓的，等到那个时候或许会更惨一些。
第二天天一亮，中华军的军队已经完全控制住了巴达维亚整个城区，随即，王佐才派出了数十支小队对城中可能藏匿荷兰士兵以及土著士兵的居民区进行了搜查，而大军这个时候已经在举行入城仪式了。
所谓的入城仪式，就是发动群众来欢饮中华军，以此来制造出声势和氛围，以震慑城中的土著人和荷兰人，而欢迎的人员则是李文思和几名城中的华商组织起来的，实际上也不是特别难办，主要是他们手底下的华人工匠和民众。城中的华人是一大片一大片的定居的，荷兰人施行的是一种类似于后世的工头一样的管理制度，将事情交给华人之中的首领，再由这些首领来组织人手去完成荷兰人教派的工作和任务，时间一长，这样的组织便因为分工种类的不同分成了十几股，大一diǎn的类似于李文思这样的，手底下的工人的数量在五千人以上，多一diǎn的甚至超过了万人的规模。
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