此事之后，桂小五郎亲自拜托剑心放弃幕后刽子手的身份转为维新前线的游击剑士参与维新革命。失去了挚爱的剑心为创造新时代决定继续战斗。[3]
明治初期
在维新志士于戊辰战争推翻幕府后，剑心决心不再杀人，在腰部佩带由新井赤空所铸造的逆刃刀开始流浪于日本各地。
十年后（明治十一年），在东京遇上神谷薰，[3]并解决伪·刽子手拔刀斋的事件，后来剑心得到神谷薰的挽留而在神谷活心流道场居住下来。其后认识了被迫作小偷的明神弥彦，剑心救出弥彦后说服薰收弥彦为徒。与讨厌维新志士、外号「斩左」的打架高手相乐左之助决斗后成为好友。
从武田观柳手上救出被迫生产鸦片的高荷惠。其间剑心经历了多次战斗，包括与同是曾为刽子手的鹈堂刃卫的战斗中变回刽子手拔刀斋，幸得薰的呼叫才清醒过来。后来再次与幕末时代的对手斋藤一的决战后，剑心自觉已经不能压抑心中的刽子手拔刀斋灵魂，[10]加上大久保利通被志志雄真实一党暗杀，得知志志雄一党阴谋的剑心决定独自前往京都与志志雄一党对决。剑心在京都得到比古清十郎传授飞天御剑流的最终奥义，[4]在决战中打败了志志雄。
在剑心回到东京后，雪代巴的亲弟雪代缘从中国回到日本，并集合了六人同志向剑心展开复仇行动。剑心向众人讲述自己与雪代巴的过去，并与神谷薫约定在决战以后会一起生活。后来在神谷活心流道场的决战中，雪代缘捉走神谷薫并制造神谷薰已死的假象引致剑心意志消沉，最后剑心恢复斗志并打败雪代缘。雪代缘由神谷薰手上得到雪代巴留下的日记后，从此消失于剑心等人面前。不久剑心与神谷薰结婚并诞下一子绯村剑路。数年后剑心将逆刃刀交给元服的明神弥彦。请持续关注我们，更新最快的小说网站www.kenshu.cc
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