作战编组，又称任务编组，联邦宇宙军分为编号舰队、特混舰队、特混大队、特混小队和特混分队。具体兵力组成根据任务需要而临时编队，任务完成后各部队返回原行政建制单位。目前，联邦宇宙军战区作战编组如下
驻月球托勒密基地驻留舰队――下辖第1，4，5，6，7舰队
新星驻留舰队――下辖第2，3舰队
驻地球低轨道舰队――第8舰队
大西洋联邦宇宙军军官由现役军官和后备役军官组成。军衔分为10个等级，
尉官：少尉、中尉、上尉
校官：少校、中校、上校
将官：准将、少将、中将、上将
其中上将分为四星上将和五星上将，在和平时期不设置五星上将军衔，只对战争中战功突出、功勋卓著的高级将领晋升五星上将军衔。联邦宇宙军在军官和士兵之间设置准尉军衔，主要适用于从事专业技术的的军人，比如水手长、轮机长等职务。准尉军衔分为四个等级，即一级、二级、三级和四级。只晋级不晋衔，即四级准尉可以晋级三级、二级或一级准尉，但是不能晋升少尉。
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