始皇心里已感到受骗，于是命令御史案问诸生，互相揭发牵连四百六十余人，始皇下令把他们都在咸阳活埋。这就是著名的“坑儒”。
某些人认为《史记》记载秦始皇坑杀的乃是术士“及至秦之季世，焚诗书，坑术士，六艺从此缺焉。”），并不是儒生。
但根据《史记·秦始皇本纪》记载秦始皇坑杀的人“皆诵法孔子”。也有记载道——始皇闻亡，乃大怒曰：“吾前收天下书不中用者尽去之。悉召文学方术士甚众，欲以兴太平，方士欲练以求奇药。去不报，徐市等费以巨万计，终不得药，徒奸利相告日闻。卢生等吾尊赐之甚厚，今乃诽谤我，以重吾不德也。诸生在咸阳者，吾使人廉问，或为訞言以乱黔首。”
这也就是说，秦始皇统一六国以后，就打起长生不老的主意，但是又因为不得其法，或者由人说了实话——要想长生不老是不可能的，于是秦始皇大怒，认为这些方士和术士欺骗了他，盛怒之下下令坑杀方士和术士，累及儒家和其学说，而方士和术士与儒者在当时也没有明确的区分。
这一切都足以说明秦始皇求长生不老之心有多么迫切，但是事实真的是这样的吗？
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