军事：
海军紧缩政策
杰斐逊执政第一年大幅度削减海军经费，使海军遭受严重打击:到1801年底，美国海军仅有6艘快速战舰和1艘三桅纵帆式帆船，其余舰船都被拆除武器拍卖，所有在建和计划建造的舰只都成为泡影;仅存的6艘快速战舰也只允许配备2/3的额定人员，其余军官全部退役，特工人员和文职人员都被解雇;建造干船坞和港口工事的工作被放弃。杰斐逊紧缩海军的政策遭到海军内部的强烈抵制，以致他先后物色的4位海军部长人选都拒绝出任这一职务。
此后在同北非海盗国家的战争中，美国政府被迫逐渐增加海军经费，使其由1802年的91.5万美元增加到1805年的140万美元。同时，对北非海盗国家的战争却激发了杰斐逊对炮艇的极大兴趣。在北非地中海沿岸的浅水海域中，炮艇发挥了重要作用，欧洲国家和北非海盗国家也拥有此类舰只，用于海岸和港口防御。当时的公众舆论认为，一支由炮艇组成的舰队能够驱走甚至捕获或击毁敌人的快速战舰。在杰斐逊看来，建造一艘炮艇只需要数千美元，这是很划算的。杰斐逊向国会和海军将领及华盛顿造船厂负责人历数了发展炮艇的种种好处，建议建造200艘炮艇。1803年，国会批准建造15艘炮艇，其中8艘被派往地中海服役，1805年又建造了25艘。1806~1807年期间，新造了238艘。这些炮艇每艘长50英尺、装备1门长炮。大量炮艇和海岸要塞的建造，表明了发展炮艇逐渐成为杰斐逊海军政策的核心，联邦党人发展快速战舰的海军政策被彻底放弃。
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