这场战争造成30万至100万人的死亡，共和国消亡，佛朗哥则离其独裁者的梦想又近一步。佛朗哥将所有的右翼政党整合为改组后的长枪党，并禁止左翼和共和政党以及工会的活动。
战争期间双方都是残酷无情的，平民被屠杀或监禁的情况随处可见。战后的1939年至1943年，成千上万的共和派遭到监禁，高达15万1000人被处死。许多共和派遭到流放，直到佛朗哥时期结束之后才回到国内。
佛朗哥时期
西班牙在一战和二战中都保持中立，仅于1941年至1943年间派遣由志愿者组成的“蓝色师”协助德国对苏作战，但在内战期间仍然遭受战火之苦。佛朗哥执政期间，西班牙在经济和文化上基本与外部世界隔绝，但是随着经济的复苏，它迈出追赶其邻国的步伐。佛朗哥时期，西班牙曾积极寻求从英国手里收回直布罗陀海峡，并在联合国中寻找支持。60年代，西班牙开始对直布罗陀地区施加限制措施，并最终于1969年关闭国境线，并直至1985年才重新开放。
西班牙在摩洛哥的统治至1967年宣告终结。虽然在1957-1958年的伊夫尼战争中获得军事上的胜利，但是西班牙仍逐渐地放弃非洲的殖民地。1968年，它同意西属几内亚独立成为赤道几内亚；1969年，它又将位于摩洛哥内的飞地伊夫尼割让给摩洛哥。
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