萨迦派：萨迦，藏语意为灰白土，因该派的主寺――萨迦寺建寺所在地呈灰白色而得名。创始于一零七三年，由于该教派寺院围墙涂有象征文殊、观音和金刚手菩萨的红、白、黑三色花条，故又称花教。萨迦派的教主由款氏家族世代相传。有血统、法流两支传承。萨迦派不禁娶妻，但规定生子后不再接近女人。僧人戴红色、莲花状僧冠，穿着红色袈裟。十三世纪中，萨迦派展成具有强大政治势力的教派，有过著名的“萨迦五祖”。其中，萨迦四祖萨班兖坚赞，于一二四七年率西藏各个封建势力归顺蒙古。萨班去世后，萨迦五祖八思巴，受到元朝皇帝极大的恩宠，被封为“国师”、“帝师”、“大宝法王”，并奉命创制了“八思巴文”。这种蒙古新文字，流通蒙古全境，促进了蒙古的社会、文化进步。萨迦派教义是属于“时轮金刚法”和“金刚持法”的体系传承。时轮金刚法至今是藏传佛教最重要的学科之一。
萨迦派于一五五零年在四川德格贡钦寺设立了德格印经院，是藏区最著名的印经院。专门刻印藏传佛教经书、历法和医学等千多种典籍，对保护和弘扬佛教起了重要作用。
宁玛派(红教)：宁玛派即旧教派。它的名称含有“古”、“旧”两种意思。就古义而言，这一派自称他们的教法是由莲花生所
一世纪形成，是藏传佛教中最早产生的一个教派。言，这一派自称以传承吐蕃时期所译的密教典籍为主，不同于佛教后弘期的仁钦桑波等人所译的新派密教经典。它是最早传入西藏的密教并吸收原始苯教的一些内容，重视寻找和挖掘古代朗达玛灭佛时藏匿的经典。由于该教派僧人只戴红色僧帽，因而又称红教。
某些地方对僧侣的要求不甚严格，可以娶妻生子。如今，红教不仅在中国藏区传播，在印度、尼泊尔、不丹、法国、美国等多个国家也有分布。宁玛派最重视“伏藏”(被埋藏的经典称为“伏藏”，专门掘“伏藏”的称为掘藏师)。由十二世纪中叶起，6续出现了不少著名的掘藏师，其中又有南藏、北藏之分。由此形成卫藏地区宁玛派的两个支派。宁玛派的教义最突出的东西是“大圆满法”，该法主张“体性本净，自性顿成，大悲周遍”。这和内地佛教禅宗主张的“心静则佛”有点相似。自五世**开始，历届西藏地方政府，每逢战争、灾荒、瘟疫等，都要请宁玛派僧人作法~解，宁玛派高僧曾一直作为噶厦政权专门祈祷师，负责占卜问卦。
举派(白教)：该派于十一世纪展起来，重视密宗学习，创立者先后有穹布朗觉巴和玛巴罗咱瓦(玛巴译师)，他们都曾到印度学习了不少的密法，主要是学《四大语旨教授》。“语旨”是佛语的意旨，由祖师口语相传，代代延续故称为语传，藏名叫“举”。因该派僧人按印度教的传统穿白色僧衣，故称为白教。举派本来创始于玛巴译师和米拉日巴二人，但他们二人都没有修建寺庙，招聚僧人，所以传法事业展不大，到他们的第三代达布拉吉时，才在达布地区建立冈布寺，招聚门徒，弘传玛、米二人所传举教授。举派创始人米拉日巴(1o4o-1123))，师承玛巴译师(他修成了最为弦妙莫测的“夺舍秘法”。即是将一种身体的心识迁移到另一个身体上，或者是从一个地方转移到另一个地方，进入一种由修法者独自选择而决定的转世状态，即如我们所说的借尸还魂)。玛巴译师是噶举派的第二代祖师，是全藏最著名的瑜伽大修士。他七岁丧父，遭叔父欺凌，受母之言学咒术杀死怨家多人后深悔其罪，故跟玛巴学法。玛巴最初不传法而先用种种苦行折磨和考验他，后圆满传授给以语旨教授。此后他长年在深山闭关苦修，缺衣少食，生活极为艰苦，曾有一年以麻为食，肢体长出了绿绿的毛，肤色也像一样，形同鬼魅。据传练成了空中飞行之术，晚年才开始收徒传法，八十四岁圆寂于聂拉木。
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